近年来下一代测序技术(next generation sequencing, NGS),已经逐渐广泛地应用到肺癌治疗中。下一代测序技术,又称高通量测序技术,下文简称二代测序。既然提到二代测序,那首先要说一说一代测序。一代测序,又称sanger测序,是由sanger在1977年发明的一种测序方法,它具有准确率高,速度快的特点,但一次只能测一条较长的序列。而二代测序,其最重要的特点就是一次可以测大量的序列,这也是它被称为高通量测序的原因。打个比方,如果说一个人的基因图谱是一本书,那么一代测序是1个人看书,这个人一次可以看5页。而二代测序是同时找100个人看书,每个人一次看可以1页。这样,二代测序可以更快的看完一本书。
 
        临床上现有的二代测序,主要有三种层面:第一种应用最多,人为挑选一部分基因组成套餐进行测序,例如将指南中推荐的9个靶向治疗的相关基因打包在一起进行检测。市面上也有多种检测套餐,大的套餐可以包含300-400个基因。第二种是全外显子检测,将所有已知的编码基因进行检测。在此基础上,可以得知肿瘤突变负荷等更多的信息。第三种是全基因组测序,全基因组测序还包含了编码基因的之间的序列。
 
二代测序有什么优势?
        首先,单基因检测仅覆盖几个常见基因以及已知的突变类型,而二代测序的套餐可以覆盖其它罕见突变、未知突变类型以及某些指南未推荐的基因,未来如果有针对新靶点的药物上市,接受二代测序的患者会因此受益。
 
        其次,单基因检测常用的PCR法对组织的要求较高,如果活检样本较少,就难以完成多个基因的单基因检测。而二代测序可以用少量组织完成大套餐的基因检测。
 
        再次,二代测序的灵敏度更高,对于基因突变发生率较高的人群,常规基因检测为阴性时,可以使用二代测序再次检测。最后,对无驱动基因突变的患者,二代测序可以获得肿瘤突变负荷及PD-L1表达等信息,可以用于预测免疫治疗的疗效。